Sezonske bitke počinju u Naruto Free Fightu: Sezona 2. Ulazak u bitku: Naruto Uzumaki, Sasuke Uchiha i Kakashi. Odaberite heroja kojem ćete pomoći da porazi rivale i bit ćete premješteni na mjesto gdje će bitka izravno započeti. Nekoliko neprijatelja odjednom će napasti vašeg lika. Dolazit će jedan po jedan, a zatim u skupinama. Uz pomoć ZX tipki morate prisiliti borca da odbija napade, a bolje je napasti se i krenuti naprijed, sakupljajući bonuse i prolazeći nivoe. Udarajte protivnike preciznim udarcima i udarcima. Koristite svoje posebne sposobnosti samo u ekstremnim slučajevima, kada u Naruto Free Fight: Season 2 bude previše neprijatelja.