Mladi momak Naruto smatra se jednim od najboljih ruku prsa u prsa. Naš heroj često pomaže u bitkama protiv mračnih nindža naredbi. Tako će danas morati izvršiti brojne misije, a u igri Naruto Ninja Council vi ćete mu u tome pomoći. Ispred sebe na ekranu vidjet ćete svog lika koji će se nalaziti u određenom području. Pomoću kontrolnih tipki natjerat ćete svog junaka da krene naprijed. Na svom putu naići će na prepreke i zamke, koje će Naruto morati zaobići ili ih preskočiti brzinom. Čim sretnete neprijatelja, bitka započinje. Morat ćete udarati neprijatelja udarcima i udarcima, kao i izvoditi tehnike. Vaš zadatak je nokautirati protivnika i za to osvojiti bodove.