Bijela ptica po imenu Bob odletjela je na jug kao dio svog jata, ali kada su preletjele grad, ptica se zainteresirala za činjenicu da neke ptice ostaju prezimiti i neće letjeti. Odlučila je da ostane malo iza čopora i pita zašto se to dešava. Spuštajući se niže, ptica je bila okružena visokim zgradama i uspaničena, a panika nikada nije dovela ni do čega dobrog. Morate pomoći ptici u Flappy Bobu. Ona više ne želi ništa da zna, jedina želja joj je bila da pobegne iz kamene urbane džungle i sustigne svoje stado. Važno je ne dirati zidove i krovove kuća u Flappy Bobu i pokušati zadržati pticu na određenom nivou.