Kada virus napadne, organizmi pokušavaju sami da se izbore sa njim, ali ih nema uvek dovoljno, pa morate pomoći raznim lekovima ili vakcinama. U igri Kill the Virus naći ćete se unutar procesa i pomoći sivoj ćeliji da se bori protiv napada brojnih crvenih virusa. Oni će napadati sa svih strana, a vi ćete pritisnuti sivu ćeliju tako da ona uzvrati. Svaki promašaj jača virus, postaje jači i teže ga je uništiti. Vaša ćelija ima deset života, pobrinite se za njih, kada ih ponestane, ćeliju će pogoditi virus u Kill the Virus.