Čuveni crtani lik, spasilac čovječanstva, desetogodišnji Ben Tennyson ima prednost u odnosu na druge zemljane po tome što može koristiti poseban sat vanzemaljskog porijekla, koji ga može pretvoriti u razne predstavnike drugih planeta. Ali u igri Ben 10 Run neće biti transformacija, junak će se oslanjati na vlastitu snagu i izdržljivost. Morat će trčati preko otvorenog pustinjskog područja, preskačući razne prepreke. Razlog njegovog bijega je nestanak njegove rođake Gwen. Sve morate učiniti brzo bez gubljenja vremena, tako da morate pomoći heroju da preskače prepreke i skuplja kristale u Ben 10 Run.