Vojska živih mrtvaca napala je biljno carstvo. Krećući se putem prema glavnom gradu, uništava sve na svom putu. U Plants vs Zombies TD komandovaćete odbranom glavnog grada. Određeno područje bit će vidljivo na ekranu ispred vas. Morat ćete identificirati strateški važne lokacije. Nakon toga ćete, koristeći posebnu kontrolnu ploču, izgraditi odbrambene građevine na ovim mjestima, kao i podići cvijeće vojnike. Kad im se zombiji približe, vaše će biljke otvoriti vatru i uništiti neprijatelja. Za svakog ubijenog zombija dobit ćete bodove.