Spider-Manu se ponekad događaju neobične stvari, posebno u posljednje vrijeme. Može spavati u svojoj kući i probuditi se na potpuno drugom mjestu. Ovo je neka vrsta magije ili super tehnologije, morate saznati prije nego što se pogorša. U igri Marvel Ultimate Spider-man Mystery City, vi i super heroj ćete se naći u misterioznom gradu kojeg nema na karti. Najvjerovatnije je u paralelnom univerzumu. Spider-Man želi razumjeti kako se transportira u svemiru i zašto baš ovdje. Za kretanje po gradu. Potrebno je skočiti i sletjeti točno na plave pločice, u protivnom se junak može ozlijediti u Marvel Ultimate Spider-man Mystery Cityju.