Izbio je rat između vaše zemlje i susjedne države. U igri Atari Missile Command zapovijedaćete odbranom vojne baze u kojoj služite. Ispred sebe na ekranu vidjet ćete zgrade svoje baze i raketnog oružja svuda instalirane. Neprijatelj je ispalio masu raketa na vašu bazu, a vi ćete se pojaviti na nebu. Morat ćete ih sve oboriti i spriječiti da padnu na teritoriju baze. Da biste to učinili, pomoću miša postavite nišan za svoje instalacije uz pomoć plavih križeva. Otvorite vatru kad budete spremni. Ako vam je pogled precizan, oborit ćete neprijateljske rakete i za to dobiti bodove. Ako ih akumulirate, nadogradite svoje instalacije i municiju za njih.