Na jednoj naučnoj stanici, katastrofa se dogodila na jednoj od planeta koje plutaju u orbiti. Naučnici su eksperimentirali sa genima vanzemaljaca, ali nešto je pošlo po zlu. Virus je pobjegao iz epruvete i pogodio mnoge ljude. Sada su se pretvorili u čudovišta i lutaju koridorima baze. Vi u igri Alien Infestation FPS u odredu vojnika bit ćete poslani u stanicu radi uništavanja čudovišta i spašavanja preživjelih. Morat ćete proći kroz hodnike stanice i koristiti vaše oružje da uništite sva čudovišta koja ćete susresti u odjeljcima baze.
