Junak minijaturnih piksela vodi Micro Metroida na putovanje kroz svijet mikro platformi u stilu Metrovanije. Pomozite mu da prođe opasna područja na platformama, a oni će postati još brojniji. Čuvajte se zupčanika i birajte mjesta gdje možete skočiti na platformu i nastaviti dalje. Na putu će biti zastavice - to su kontrolne tačke koje će vam pružiti mjesto gdje će se heroj vratiti ako se navuče na šiljke ili padne s platforme u Micro Metroidu.
