Voće u Fruit Ninja nije namijenjeno za jelo kao salate ili samo za zabavu. Gomilu voća prikupio je junak nindža igre, kako ne bi izgubio svoje vještine sa mačem katane. Junak radi kao kuhar u kafiću, prije nekoliko godina napustio je rodnu zemlju ne svojom voljom, već krijući se od lokalne mafije. Ali ruke mafije su dugačke i mogu ga pronaći u svakom trenutku, što znači da morate biti spremni i potrebna je obuka. A kako pri ruci nema posebne sportske opreme, morat ćete koristiti voće. Pomoćnik će bacati lubenice, banane, jabuke, kivi i drugo voće, a vi ćete ih rezati u Fruit Ninja.
