Duboko u džungli živi gorila po imenu Magarac koja uvijek pomaže svojim prijateljima. Jednom je naš lik odlučio da ode u posetu svojim daljim rođacima koji žive s druge strane džungle. Vi ćete u igri Super Donkey Kong 99 morati pomoći heroju u ovoj avanturi. Vaš lik će biti vidljiv na ekranu ispred vas, koji će se pod vašim vodstvom kretati naprijed duž putanje, postepeno povećavajući brzinu. Na putu, vaš lik će morati skupljati banane i zlatnike razbacane posvuda. Takođe će morati da savlada razne zamke i prepreke koje će mu naići na putu.
