Hrabri samuraj po imenu Jack član je tajnog reda koji štiti mir našeg svijeta od raznih čudovišta iz paralelnih svemira. Jednog dana, nekoliko čudovišta je uspelo da probije vremenske portale u naš svet. Sada će naš junak morati putovati uz pomoć posebnog amajlija prema ovim vremenima. Tamo će morati pronaći čudovišta i uništiti ih. Vi ćete u igri Samurai Jack: The Amulet Of Time pomoći samuraju u ovim bitkama. Ispred vas, vaš lik će biti vidljiv na ekranu, koji će se nalaziti u određenom području. Ispred njega ćete vidjeti čudovište. Koristeći kontrolne tipke, morat ćete natjerati svog heroja da napadne neprijatelja. Udarajući mačem, uništit ćete neprijatelja i dobiti bodove za to.