Kadeta Williamsa je general Mudd direktno zadužio u Zapovjednik trupa: Slime Invazija da brani blokadu na putu. Očekuje se napad vanzemaljaca, čija se invazija dogodila dan ranije. Nakon što poslušate kratka uputstva, morate preći na akciju. Kadet ima na raspolaganju mali odred i komplet opreme. Možete ga odabrati na dnu ekrana. Odred će djelovati bez vašeg sudjelovanja, poput tenkova i topova, a vi možete kontrolisati kadeta pucanjem i kretanjem. Troop Commander: Slime Invasion je sličan odbrambenim kulama, ali sa značajnim dodatkom - možete kontrolirati glavnog lika.
