Dječak po imenu Jack poznati je nasilnik u gradu koji neprestano slika zidove gradskih zgrada. Jednom je stigao do stanice i tamo počeo slikati drugu sliku. Zbog toga ga je uhvatio policajac i sada će naš momak morati pobjeći od njega. U Rail Runneru pomoći ćete Jacku u ovoj avanturi. Ispred sebe na ekranu vidjet ćete svog lika koji će trčati željezničkom prugom postupno dobivajući na brzini. Putem će se pojaviti razne prepreke. Kad se vaš junak približi jednoj od prepreka, morat ćete koristiti određene kontrolne tipke. Tada će vaš junak skočiti i preletjeti ovu prepreku. Ako nemate vremena za reakciju, on će se u bijegu zaletjeti u nju i ozlijediti se.
