Hrabar nindža Kjoto mora ući u zaštićeni zamak i ukrasti odatle jedan artefakat koji je jednom ukrao svoj hram svog naređenja. Ti u igri Jump Ninja Hero pridružit će se njegovim avanturama. Da bi došli do zamka, naš junak mora proći kroz određeno područje, čuvano od neprijateljskih vojnika. Naš junak će stalno pucati iz luka, krstova i drugog oružja. Vozite našeg heroja moraće da izbegne sve leteće predmete u njemu. Samo tako da može preživjeti i doći do krajnje tačke svog putovanja.
