U igri Kingdom of Ninja ići ćete u kraljevstvo u kojem žive nindža ratnici. Poslednjih godina su bili loši vremenski uslovi i usevi su dali vrlo malo, a počela su da se pojavljuju i krvožedna čudovišta. Sam kralj je odlučio da ispravi situaciju, jer je odgovoran za živote svojih stanovnika. Da bi to učinio, morat će sići u katakombe ispod grada, jer su odatle noću počela izlaziti stvorenja tame. Osim toga, pročitao je u drevnim svicima da su drevna blaga skrivena u ovim labirintima, a ako bi se sva sakupila, zla čarolija bi se raspršila. Vi ćete pratiti svog heroja, koji izgleda kao crni kvadrat sa crvenom prugom na očima. Da bi ispunio sve uvjete iz drevnih kronika, morat će otići u podzemlje nenaoružan i samo će mu nevjerovatna spretnost pomoći da prođe sve testove. Od prvih koraka moraće da se suoči sa raznim vrstama zamki, rupama u zemlji i visokim platformama. Na nekim mjestima ćete se morati penjati po zidovima da biste došli do sljedećeg sprata. Ako usput sretnete čudovišta, onda ih ne biste trebali pokušavati napasti, jer nema šanse da dobijete bitku. Bolje je samo preskočiti i nastaviti potragu za škrinjama s blagom u Kingdom of Ninja.