Naš hrabri nindža heroj u igri Ninja protiv EVILCORP bori se protiv svih manifestacija zla u virtualnom svijetu najbolje što može. Nedavno je dobio informacije o predstojećem globalnom zločinu. Planove razvija Evil Corporation, čiji je ured u centru grada. Ovo je visoka zgrada od stakla i betona, opremljena modernim sigurnosnim sistemima. Junak namjerava tamo prodrijeti i zgužvati informacije o planovima s računara. Ako postanu poznati, postoji šansa da se spriječi provedba zlog plana. Pomozite junaku, morat će proći na desetke katova, a na svakom će cilju biti ured s računarom. Prvih nekoliko katova dovoljno je lako proći, ali dalje će se pojačati sigurnost. Prvo će se pojaviti automatske kamere, a zatim i sami čuvari. Ninja ne smije biti pod snopom svjetiljke ili svjetiljke, u protivnom će ga primijetiti i uhvatiti.