Vaša podmornica obavlja zadatak zaštite vodene granice države. Neprijatelj može napadati ne samo na kopnu, u zraku, vodi, već i pod vodom. U igri Mashi Deep morate odbiti pet talasa napada. To je onoliko koliko neprijatelj ima dovoljno snage. Njegova podmornička flota nije neograničena, ako stojite, odbrana neće moći probiti. Plivajte i pucajte, uništavajući sve na svom putu. Nakon sledećeg talasa, morate se boriti sa šefom, zastavom i to je ozbiljno. Svaki šef je jedinstven sa svojim posebnim sposobnostima i trikovima.