U dalekoj budućnosti naučnici su naučili da smanjuju predmete na mikroskopske veličine. Danas u igri Spore Hunter, odlučili su poslati pilota na specijalnoj letjelici kako bi istražili mikro svijet. Vaš heroj će morati letjeti određenom rutom i istraživati u200bu200bovaj svijet. Stvorenja koja se sastoje od spore napadnut će našeg heroja. U njima će biti vidljivi uneseni brojevi. Znače koliko hitaca trebate da napravite biću da biste ga uništili. Vi pametno manevrirajući na svom brodu, pucaće na njega iz vašeg oružja i uništiti spore.