Postoji veliki broj ljudi, među kojima su eminentni naučnici koji veruju da su vanzemaljci već dugo došli na zemlju, žive među zemaljima i utiču na njihove živote. U igri Clowns Vs Aliens možete sprečiti takav scenario za hvatanje planete i pomoći vam klovnova, koju vodi kapetan Paisi. On je sastavio originalni arsenal da uništi vanzemaljce i poziva vas da ga koristite za odbranu. Oružje se nalazi na levom vertikalnom panelu. Za početak će vam biti dostupni samo crni baloni. Oni će se lako baviti prvim talasima napada. Sledeće nam treba oružje. Pristup njima otvara se kada je skala iznad kuglica puna.