Tim kornjača nindže ima veoma ozbiljnog neprijatelja. Zove se Savanti Romero. Ovaj zlikovac je napravio vremensku mašinu i sada prikuplja čudovišta iz svih svetova: prošlost i budućnost, da ih ujedine u veliku vojsku. Heroji se moraju mešati u planove neprijatelja. Da bi to uradili, morat će posjetiti sva mjesta gdje Romero planira da ide i neutrališe sve koje pokušava preći na svoju stranu. Mike, Raphael, Leo i Donald su spremni za opasna putovanja. Morate izabrati prvi par kandidata, oni će biti prebačeni u drevni Egipat. Tamo će se sresti sa zlim mumijama. Drakula i zombiji čekaju ih na još ne manje opasnim mjestima igre Teenage Mutant Ninja Turtles Monsters Vs Mutants