Sa razvojem civilizacije, čovječanstvo je počelo da putuje kroz galaksiju i istražuje različite planete u potrazi za životom. Otkrili usamljenu planetu, tamo su osnovali kolonije. Ali ono što bi se dogodilo je da se očisti mesto za izgradnju zgrada. Ti si u igri Subteralien i uradi to. Od vašeg broda do planete, šatl se spušta i ulazi u mjesto koje ste izabrali. Oko će biti raznih objekata. Morate kliknuti sa svojim mišem da ih usmerite i otvorite vatru raketama. Oni će eksplodirati i uništiti sve objekte. Stepen štete će se videti iznad. Čim se popuni, idete na sledeći nivo.